El Ayuntamiento de Setúbal es el órgano ejecutivo colegial del Municipio de Setúbal y tiene como misión definir y ejecutar políticas orientadas a la defensa de los intereses y satisfacción de las necesidades de la población local.

En ese sentido, le corresponde promover el desarrollo del municipio en todas las áreas de la vida, como la salud, la educación, la asistencia social y la vivienda, el ambiente y saneamiento básico, la planificación territorial y el urbanismo, los transportes y comunicaciones, el abastecimiento público, el deporte y la cultura, la defensa del consumidor y la protección civil.

Como órgano ejecutivo, es elegido por los ciudadanos electores censados en su área, y está constituido por un alcalde y ocho concejales, uno de ellos con el cargo de teniente alcalde.